Identificación De Genes Core Y Vías Clave Asociadas A Fibrosis Uterina Mediante Análisis Bioinformático Integrado

Abstract

Introducción: La Fibrosis o leiomiomas uterinos es una enfermedad del músculo liso que se caracteriza por la presencia de tumores benignos. Estos tumores son del miometrio y tienen baja tasa de malignidad. Los síntomas que pueden presentar las pacientes son metrorragia o menorragia, dismenorrea, dolor pélvico no cíclico, dispareunia, Incontinencia o retención urinarias, constipación, síntomas asociados a anemia e infertilidad; Phelippeau y Fernandez, 2016. Las bases genéticas de la fibrosis uterina se basan en las diferencias transcripcionales, estas diferencias se caracterizan por los impulsadores genéticos que pueden ser reconocidos., Mehine, et al., 2016. Se conoce que las diferencias transcripcionales pueden ser; reordenamiento del grupo de alta movilidad AThook2., HMGA2, mutaciones de la subunidad 12 del complejo mediador, inactivación bialélica del fumarato hidratasa y colágeno y Deleciones IV, alfa5 y colageno, tipo IV alfa 6., Mehine, et al., 2016., Laganà, et al., 2017. Objetivo; Determinar los genes core y vías clave asociadas a fibrosis uterina mediante análisis bioinformático integrado Materiales y métodos; Se recolecto dos datasets del repositorio GEO NCBI; GSE169255 y GSE199849. Los datos fueron procesados para determinacion de DEGS a traves de un codigo realizado en lenguaje de programacion R. Posteriormente los DEGS identificados como comunes fueron analizados en DAVID para definir terminos GO, en base a tres categorías; funcion biologica, componente celular y funcion molecular. Se utilizo KEEG para determinar vias clave asociadas a los DEGS. Finalmente se procesaron los datos en la plataforma STRING para la contruccion de redes de interaccion y CYTOSCAPE para la selección de modulo hub. Resultados; Se identificaron un total de 444 DEGS down regulated y 595 DEGS up regulated. De ellos el 97.2 por ciento de genes se encuentran asociados en términos ontológicos con componentes celulares, caracterizado mayormente por la participación en la formación de matriz extracelular, citoesqueleto celular y regulación en la transcripción. Las vías clave en los genes up regulated están asociadas a la replicación de ADN. Las vías clave dadas por los genes downregulated se encuentran en relación con vías metabólicas como degradación de ácidos grasos, glucolisis, gluconeogénesis y resistencia a la insulina. Se determinaron como genes hub la familia de genes COL, TGFB-I y SEPRHIN1 en la categoría up-regulated. En los genes down regulated se determinaron como genes hub la familia de genes HOX, NFIB y KKLF4. Conclusiones; Los genes up regulated se encuentran asociados con el crecimiento y proliferación de células para la formación de tumores benignos a través del aumento de matriz extracelular y aumento de la replicación celular. La regulación a la baja de la familia de genes HOX explica porque los leiomiomas no progresan a malignidad.