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http://dspace.udla.edu.ec/handle/33000/7442
Registro completo de metadatos
Campo DC | Valor | Lengua/Idioma |
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dc.contributor.advisor | Rivas Romero, Fernando Xavier | - |
dc.creator | Ruano Chávez, Miguel Mateo | - |
dc.date.accessioned | 2017-09-22T15:51:09Z | - |
dc.date.available | 2017-09-22T15:51:09Z | - |
dc.date.issued | 2017 | - |
dc.identifier.citation | Ruano Chávez, M. M. (2017). Desarrollo de un sistema para tipificación de polimorfismos de nucleótido simple (snps) en el gen hif-2? involucrados en la respuesta adaptativa a hipoxia por altura mediante Snapshot® multiplex. (Tesis de pregrado). Universidad de las Américas, Quito. | es_ES |
dc.identifier.other | UDLA-EC-TIB-2017-13 | - |
dc.identifier.uri | http://dspace.udla.edu.ec/handle/33000/7442 | - |
dc.description | Hypoxia Inducible Factor 2 α HIF2 α is the leading gene involved in the adaptation of the organism to hypoxia conditions. This gene encodes for the second isoform of the alpha subunit of HIF transcriptional factor, which regulates the expression of more than 100 genes associated with oxygen dependent metabolic pathways. SNPs in the HIF2 α gene, affecting protein HIF2 α, have been linked to the regulation of vascular angiogenesis, blood viscosity and hepatocyte proliferation, pancreatic and placental cell development, in diseases, such as retinal ischemia, arterial and pulmonary hypertension, and even oncogenic processes, such as melanoma. The importance of studying SNPs lies in the fact that, depending on their location, they have serious implications on the organism. The Gold Standard method for determination of SNPs is the fluorinated sequencing by the Sanger method. However, typing SNPs by this method involves considerable investment of money, time, and supplies, since it requires sequencing both strands of the DNA fragment. To overcome these drawbacks, SNaPshot technology was proposed, which allows the genotyping of up to 20 SNPs, even on different chromosomes, in one Multiplex PCR reaction and capillary electrophoresis run. It is for this reason that the major aim of the project was to develop the first typing protocol using the SNaPshot system in Ecuador, using the HIF2 α gene as an object of study. To fulfill the objectives of the present work, a SNaPshot based system was designed to typify seven SNPs in the HIF2 α gene, using a pair of primers and a probe per SNP. In this manner, the commercial control DNAs 9948M, 9947A, K562, C007, were used, based on which the conditions of the PCR and the SNaPshot Multiplex Kit were adjusted, finally, the results were validated using the Gold Standard method. Based on validation and cost analysis, it was concluded that SNaPshot Multiplex system has the same sensitivity and specificity as the Gold Standard method, but it is extremely economical, fast, and easy to implement in the country. | en |
dc.description.abstract | El Factor Inducible por Hipoxia 2 α, HIF2 α es el principal gen involucrado en la adaptación del organismo a condiciones de hipoxia. Este gen codifica para la segunda isoforma de la subunidad alfa del factor transcripcional HIF, que regula la expresión de más de 100 genes asociados con vías metabólicas dependientes de oxígeno. Los SNP en el gen HIF2 α, que afectan a la proteína HIF2 α, se han relacionado con la regulación de la angiogénesis vascular, la viscosidad sanguínea y la proliferación de hepatocitos, el desarrollo de células pancreáticas y placentarias, en enfermedades, como isquemia retiniana, hipertensión arterial y pulmonar, e incluso oncogénicas procesos, como el melanoma. La importancia del estudio de los SNP radica en que, dependiendo de su localización, tienen serias implicaciones en el organismo. El método Gold Standard para la determinación de SNPs es la secuenciación fluorada por el método de Sanger. Sin embargo, la tipificación de SNP por este método implica una inversión considerable de dinero, tiempo y suministros, ya que requiere la secuenciación de ambas cadenas del fragmento de ADN. Para superar estos inconvenientes, se propuso la tecnología SNaPshot, que permite el genotipado de hasta 20 SNP, incluso en diferentes cromosomas, en una sola reacción de PCR Multiplex y electroforesis capilar. Es por ello que el objetivo principal del proyecto fue desarrollar el primer protocolo de tipificación mediante el sistema SNaPshot en Ecuador, utilizando el gen HIF2 α como objeto de estudio. Para cumplir con los objetivos del presente trabajo, se diseñó un sistema basado en SNaPshot para tipificar siete SNPs en el gen HIF2 α, utilizando un par de cebadores y una sonda por SNP. De esta forma, se utilizaron los ADN control comerciales 9948M, 9947A, K562, C007, en base a los cuales se ajustaron las condiciones de la PCR y el SNaPshot Multiplex Kit, finalmente se validaron los resultados mediante el método Gold Standard. Con base en la validación y el análisis de costos, se concluyó que el sistema SNaPshot Multiplex tiene la misma sensibilidad y especificidad que el método Gold Standard, pero es extremadamente económico, rápido y fácil de implementar en el país. | es_ES |
dc.format.extent | 103 p. | es_ES |
dc.language.iso | spa | es_ES |
dc.publisher | Quito: Universidad de las Américas, 2017 | es_ES |
dc.rights | openAccess | es_ES |
dc.rights | Atribución-SinDerivadas 3.0 Ecuador | * |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nd/3.0/ec/ | * |
dc.subject | GENÉTICA | es_ES |
dc.subject | ADN | es_ES |
dc.subject | BIOTECNOLOGÍA | es_ES |
dc.title | Desarrollo de un sistema para tipificación de polimorfismos de nucleótido simple (snps) en el gen HIF-2a involucrados en la respuesta adaptativa a hipoxia por altura mediante Snapshot multiplex | es_ES |
dc.type | bachelorThesis | es_ES |
Aparece en las colecciones: | Ingeniería en Biotecnología |
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