Evaluación de la expresión de un gen asociado a la calidad aromática en clones comerciales de cacao nacional mediante PCR cuantitativa

Abstract

Ecuador es reconocido a nivel internacional como el principal productor de cacao fino y de aroma, proveniente de la variedad denominada Nacional. El aroma del cacao Nacional está constituido por varios compuestos volátiles como polifenoles, aldehídos, cetonas y terpenos, entre los cuales se destaca el linalool. El linalool ha sido identificado como el compuesto responsable del aroma floral del cacao Nacional, y a pesar de su relevancia en la industria del chocolate, existe solo una investigación acerca de un gen asociado con su síntesis, el gen LIS, realizada en los tipos de cacao Nacional y Trinitario. En el presente estudio se evaluó la expresión de este gen en clones comerciales de cacao Nacional mediante PCR cuantitativa. Se recolectaron las almendras de los clones EET19, EET96, EET103 y CCN51 en la semana 20 y 22 de maduración y a las 24 y 48 horas de microfermentación de las localidades EETP y EELS del INIAP. Se extrajo el ARN de las almendras de cacao en estudio y se eliminaron los restos de polifenoles y ADNg. Se cuantificó el ARN y se lo utilizó como templado para la síntesis de ADNc. Se estandarizaron las condiciones de reacción de la PCR cuantitativa y la cuantificación relativa del gen LIS se realizó mediante el método ddCt. A partir del análisis de la expresión génica se determinó que los clones de cacao Nacional presentaron un mayor nivel de expresión del gen LIS con respecto al clon CCN51 en los tiempos de maduración y de microfermentación estudiados. El clon EET103 en la semana 20 de maduración presentó el mayor nivel de expresión de este gen, seguido del clon EET96 y el clon EET19. Los resultados demostraron que existen diferencias significativas en el nivel de expresión del gen LIS entre los clones de cacao y las condiciones analizadas. El clon EET103, que posee un aroma floral intenso, presentó el nivel más alto de expresión del gen LIS; mientras que el clon EET19, que posee un aroma floral ligero, presentó el nivel más bajo de expresión de este gen. Estas observaciones sugieren una posible correlación entre el nivel de expresión del gen LIS y la intensidad del aroma floral del cacao.