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Tipo de material : bachelorThesis
Título : Identificación de biomarcadores sanguíneos en la enfermedad de Alzheimer mediante la aplicación de herramientas bioinformáticas en el procesamiento de micro-arreglos y análisis de redes de co-expresión
Autor : Nieto Seraquive, Freddy Cristhian
Tutor : Tejera Puente, Eduardo
Palabras clave : ENFERMEDADES-DIAGNÓSTICO;MAL DE ALZHEIMER;MARCADORES BIOLÓGICOS;PSICOPATOLOGÍA-DIAGNÓSTICO;ENFERMEDADES GENÉTICAS-TRATAMIENTO
Fecha de publicación : 2017
Editorial : Quito: Universidad de las Américas, 2017.
Citación : Nieto Seraquive, F. C. (2017). Identificación de biomarcadores sanguíneos en la enfermedad de Alzheimer mediante la aplicación de herramientas bioinformáticas en el procesamiento de micro-arreglos y análisis de redes de co-expresión. (Tesis de pregrado). Universidad de las Américas, Quito.
Resumen : La enfermedad de Alzheimer es un trastorno neurológico que afecta a la población de edad avanzada, caracterizándose por cuadros de demencia que aumenta con el pasar del tiempo. Esta patología afecta a varios millones de personas en todo el mundo y los tratamientos, aún hoy en día, son deficientes. La identificación de biomarcadores para el diagnóstico temprano de la enfermedad de Alzheimer cada vez se intensifica más. Hoy en día existen biomarcadores bien establecidos para su diagnóstico, como el análisis de beta amiloide, proteína tau total en líquido cefalorraquídeo o los procedimientos con resonancia magnética. La especificidad y sensibilidad que se consiguen con estos biomarcadores son muy buenas. Sin embargo, los procedimientos para la recolección de muestra y posterior análisis son complejos y en algunos casos costosos. En este estudio, se identificaron biomarcadores sanguíneos de la enfermedad de Alzheimer mediante la aplicación de herramientas bioinformáticas en el procesamiento de micro-arreglos. Los micro-arreglo obtenidos de las bases de datos públicas Gene Expression Omnibus fueron analizados mediante diversos algoritmos y métodos bioinformáticos. Se analizó la diferencia en la expresión génica en casos y controles, para posteriormente construir redes de co-expresión con genes que sólo se diferencien en la enfermedad de Alzheimer. Los análisis de enriquecimiento de procesos biológicos fueron necesarios para comprobar la relación entre la expresión de ciertos genes y el aparecimiento de la enfermedad de Alzheimer. Con el propósito de brindar nuevas dianas de estudio, se propuso una lista de genes que son candidatos potenciales para ser biomarcadores en la enfermedad de Alzheimer. La combinación de métodos de selección de rasgos y redes de coexpresión permitió proponer los genes PRKCB, CARD8, PIK3CG, NOD2, MXD1, ZFX y PCYOX1L como biomarcadores o dianas terapéuticas potenciales para la enfermedad de Alzheimer.
Descripción : Alzheimer's disease is a neurological disorder that affects elderly population. This pathology affects several million people around the world while the today treatments are still deficient. Researches in identification of biomarkers for the early diagnosis of Alzheimer's disease are intensified. Nowadays we count with well-established biomarkers for diagnosis, such as beta-amyloid analysis, total tau protein in cerebrospinal fluid or magnetic resonance imaging (MRI) procedures. The specificity and sensitivity achieved with these biomarkers are good. However, their procedures for sample collection and subsequent analysis have an increased prize and difficulty. In this study, we identified blood biomarkers in Alzheimer's disease by applying bioinformatics tools for processing and analysis of microarrays. Microarrays obtained from the public Gene Expression Omnibus databases were analyzed using several algorithms and bioinformatics methods. Differentiation of gene expression in cases and controls was studied followed by co-expression networks analysis. Enrichment analysis of biological processes and metabolic pathways were necessary to verify the relationship between the expression of certain genes and Alzheimer's disease. In order to provide a new study target, a list of genes that are potential candidates for being biomarkers in Alzheimer's disease was proposed. Combination of features selection methods and co-expression networks allowed us to propose genes PRKCB, CARD8, PIK3CG, NOD2, MXD1, ZFX and PCYOX1L as a potential biomarkers or therapeutic targets for Alzheimer's disease.
URI : http://dspace.udla.edu.ec/handle/33000/7374
Aparece en las colecciones: Ingeniería en Biotecnología

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