Caracterización molecular de mora de zonas alto andinas del Ecuador

Abstract

El género Rubus agrupa especies pertenecientes a las rosáceas que incluyen moras y frambuesas. El cultivo de mora se ha centrado en la mora de castilla, la cual ha incremento con los años su área de cultivo siendo uno de los frutales más importantes para la economía nacional. Sin embargo, se ha reportado pérdidas importantes en los cultivos, en los cuales no se ha identificado un agente causal específico. Las principales investigaciones sobre el género se han centrado en estudios fisicoquímicos del fruto, manejo agrícola y en menor medida a la caracterización molecular. Los estudios de caracterización molecular permiten un mejor manejo de los recursos genéticos, ya que establecen conocimientos básicos sobre las relaciones genéticas, procesos de pérdida de diversidad, al igual que el flujo de genes entre las especies. Este conocimiento, a su vez permite establecer futuros programas de conservación y mejoramiento, razón por la cual el presente trabajo busca caracterizar la diversidad genética de moras de zonas alto andinas del Ecuador, utilizando marcadores moleculares microsatélites. Se caracterizaron molecularmente un total de 135 accesiones de moras, cultivadas y silvestres. En una primera fase, se estandarizaron las condiciones de PCR para 20 marcadores microsatélites reportadas para diversas especies del género Rubus. En una segunda fase se analizaron los polimorfismo de estos 20 microsatélites, donde se obtuvo un índice polimórfico promedio elevado (0,624), identificándose un total de 180 alelos, y una heterocigocis promedio observada de 0,434, representada en su mayoría por las especies silvestres del género Rubus. Mediante los análisis de asignación realizados en la especie R. glaucus, la cual se agrupó de manera diferenciada en comparación con el resto de moras analizadas, se identificó la conformación de dos grupos genéticos. Sin embargo, estas se encuentran estrechamente relacionadas, y en los análisis de variabilidad molecular se demuestra que tienen una mayor tendencia a la homocigocis y está estrechamente relacionada con un alto índice de endogamia, conociendo con el hecho que la mora de cultivo se reproduce principalmente por estacas. Estos resultados sugieren una pérdida de variabilidad genética en la especie R.glaucus que puede ser explicada por la explotación intensiva de monocultivos. Por el contrario, se observó una elevada variabilidad genética en todas las especies silvestres del género Rubus, con un posible flujo genético, entre especies.