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Tipo de material : bachelorThesis
Título : Evaluación de dos genes como código de barras de ADN para la identificación de diatomeas epilíticas en Ecuador
Autor : Haro Ruiz, Adriana Paulina
Tutor : Ballesteros Redondo, María Isabel
Palabras clave : GENÉTICA MOLECULAR;BIOLOGÍA MOLECULAR;QUÍMICA DEL AGUA;CALIDAD DEL AGUA
Fecha de publicación : 2019
Editorial : Quito: Universidad de las Américas, 2019
Citación : Haro Ruiz, A. P. (2019). Evaluación de dos genes como código de barras de ADN para la identificación de diatomeas epilíticas en Ecuador (Tesis de pregrado). Universidad de las Américas, Quito.
Resumen : Las comunidades de diatomeas epilíticas se ven influenciadas por los cambios de las condiciones ambientales de los sistemas acuáticos, siendo usadas como bioindicadores de calidad de agua. Esto requiere una identificación precisa de las especies de diatomeas basada principalmente en características morfológicas de las frústulas de sílice. Esta caracterización requiere gran experiencia, habilidad en microscopía y el uso de guías taxonómicas especializadas. Las nuevas técnicas genómicas pueden ayudar a reducir la complejidad de este proceso y complementar los procesos de bioevaluación y biomonitoreo de ecosistemas acuáticos, mediante la aplicación de marcadores moleculares para la identificación de especies refiriéndose a la implementación de un código de barras genético como una herramienta emergente de uso universal. La principal limitante en la aplicación de estos marcadores es la falta de secuencias de referencia de diatomeas epilíticas, especialmente en el caso de Ecuador. Para resolver este problema se planteó como objetivo principal del proyecto la obtención de las secuencias de dos genes candidatos (18SV4 y rbcL) como códigos de barras de ADN en diatomeas epilíticas de Ecuador, con el fin de evaluar su efectividad en la discriminación de especies. Para ello, fue necesario establecer cultivos puros de las especies de diatomeas identificadas por microscopía óptica y microscopia electrónica de barrido, obteniendo una muestra de ADN pura. A partir de la cual se verificó la amplificación y secuenciación de los genes de referencia mencionados para cada especie aislada. En el presente trabajo se han caracterizado taxonómica y molecularmente cinco especies de diatomeas epilíticas de la cuenca alta del rio Guayllabamba. Estos resultados suponen el inicio de una base de datos con las secuencias de referencia de las especies de diatomeas epilíticas de esta región, cuya disponibilidad sería aplicable para el desarrollo y aplicación de herramientas moleculares para la biomonitorización del estado ecológico de ecosistemas acuáticos en Ecuador.
Descripción : Epilitic diatom communities are influenced by changes in the environmental conditions of aquatic systems, being used as bioindicators of water quality. This requires an accurate identification of diatom species based primarily on morphological characteristics of silica frustules. This characterization requires great experience, skill in microscopy and the use of specialized taxonomic guides. The new genomic techniques can help reduce the complexity of this process and complement the bioevaluation and biomonitoring processes of aquatic ecosystems, by applying molecular markers to identify species by referring to the implementation of a genetic barcode as an emerging tool of universal use. The main limitation in the application of these markers is the lack of epilitic diatom reference sequences, especially in the case of Ecuador. To solve this problem, the main objective of the project was to obtain the sequences of two candidate genes (18SV4 and rbcL) as DNA barcodes in epilitic diatoms of Ecuador, in order to evaluate their effectiveness in species discrimination. For this, it was necessary to establish pure cultures of the diatom species identified by optical microscopy and scanning electron microscopy,obtaining a pure DNA sample. From which the amplification and sequencing of the reference genes mentioned for each isolated species was verified. In this work, five species of epilitic diatoms of the upper Guayllabamba river basin have been taxonomically and molecularly characterized. These results suppose the beginning of a database with the reference sequences of the epilitic diatom species of this region, whose availability would be applicable for the development and application of molecular tools for the biomonitoring of the ecological state of aquatic ecosystems in Ecuador.
URI : http://dspace.udla.edu.ec/handle/33000/11813
Aparece en las colecciones: Ingeniería en Biotecnología

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