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Tipo de material : bachelorThesis
Título : Análisis de la región de control “D-Loop” del ADN mitocondrial de mestizos ecuatorianos mediante secuenciación Sanger
Autor : Yépez Santos, José Ignacio
Tutor : Burgos Figueroa, Hugo Germán
Palabras clave : ADN;BIOLOGÍA MOLECULAR;ÁCIDOS NUCLEICOS;ESTRUCTURA MOLECULAR
Fecha de publicación : 2019
Editorial : Quito: Universidad de las Américas, 2019
Citación : Yépez Santos, J. I. (2019). Análisis de la región de control “D-Loop” del ADN mitocondrial de mestizos ecuatorianos mediante secuenciación Sanger (Tesis de pregrado). Universidad de las Américas, Quito.
Resumen : La población ecuatoriana se encuentra compuesta por tres grupos étnicos bien definidos: indígenas, afrodescendientes y mestizos. Estos últimos son trihíbridos debido a la influencia de grupos nativo-americanos, europeos y africanos, adicionalmente, son mayoritariamente descendientes de españoles e indígenas y componen el 60 por ciento de la población. En este estudio se analizó la región control del ADN mitocondrial (16024-576) mediante secuenciación Sanger para dilucidar la ancestría matrilineal de la población de mestizos en Ecuador y determinar la diversidad presente. Para ello, se analizaron 54 individuos no emparentados con al menos dos generaciones previas de predecesores ecuatorianos. Los haplotipos se obtuvieron al comparar la secuencia revisada de Cambridge con las secuencias obtenidas mediante SeqScape v2.7 (Applied Biosystems) y se asignaron haplogrupos mediante EMPOP (v4 septiembre 2018), todo esto según las recomendaciones de la ISFG para el análisis de ADN mitocondrial. Los haplogrupos encontrados pertenecen a poblaciones amerindias en un 95% aproximadamente. Adicionalmente, se encontró escasa contribución africana y euro asiática. Se calculó la diversidad haplotípica, el promedio de diferencias en pares y la distancia génica respecto a otras poblaciones sudamericanas similares, esto se realizó con el software Arlequin 3.5. La diversidad obtenida (0.9986 más o menos 0.0039) resultó bastante alta, acorde a estudios similares realizados en este grupo étnico en el territorio ecuatoriano. Además, el promedio de las diferencias entre pares que se obtuvo fue de 17.59 más o menos 7.93 y la distribución de dichas diferencias podría sugerir la existencia de una subpoblación dentro de la muestra analizada. Finalmente, al comparar los datos obtenidos por esta investigación con reportes de Colombia, Argentina, Perú y un estudio anterior en indígenas de Ecuador, se encontraron diferencias significativas entre todas las comparaciones. Sin embargo, al contrastar estos datos con un estudio previo realizado en mestizos ecuatorianos, no se observaron diferencias significativas, tal como se había previsto.
Descripción : The Ecuadorian population is composed of three well-defined ethnic groups: indigenous, afro-descendants and mestizos. The latter are tri-hybrid due to the influence of Native-American, European and African groups. In addition, they are mostly descendants of Spaniards and Indians and make up 60 percent of the population. In this study, the mitochondrial DNA control region (16024-576) was analyzed by Sanger sequencing to elucidate the matrilineal ancestry of the mestizo population in Ecuador and determine the diversity present. In this way, 54 individuals unrelated to at least two previous generations of Ecuadorian predecessors were analyzed. Haplotypes were obtained by comparing the revised Cambridge sequence with sequences obtained by SeqScape v2.7 (Applied Biosystems) and haplogroups were assigned by EMPOP (v4 September 2018), all according to ISFG recommendations for mitochondrial DNA analysis. The haplogroups found belong to native American populations, approximately for 95 percent of analyzed individuals. Additionally, African and Asian Euro contributions were found to be scarce. The haplotypic diversity, mean pairwise differences and genetic distance respect to other similar South American populations were calculated, this was done with the Arlequin 3.5 software. The diversity obtained (0.9986 more or less 0.0039) was quite high, according to similar studies carried out in this ethnic group in the Ecuadorian territory. In addition, the mean pairwise differences obtained was 17.59 more or less 7.93 and the distribution of these differences could suggest the existence of a subpopulation within the sample analyzed. Finally, when comparing the data obtained with reports from Colombia, Argentina, Peru and other study in Ecuadorian indigenous, significant differences were found among all the comparisons except for the data obtained from a recent study in Ecuadorian mestizos; as expected since the analyzed sample belongs to the same population.
URI : http://dspace.udla.edu.ec/handle/33000/11812
Aparece en las colecciones: Ingeniería en Biotecnología

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