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Tipo de material : bachelorThesis
Título : Detección de eventos de mimetismo molecular en el proteoma del patógeno de maíz Ustilago maydis
Autor : Espinosa Viteri, Nicole Andrea
Vizcaíno Cárdenas, Karla Stephanie
Tutor : Armijos Jaramillo, Vinicio Danilo
Palabras clave : BIOTECNOLOGÍA;BIOLOGÍA MOLECULAR;MIMETISMO MOLECULAR
Fecha de publicación : 2019
Editorial : Quito: Universidad de las Américas, 2019
Citación : Espinosa Viteri, N. A.; Vizcaíno Cárdenas, K. S. (2019). Detección de eventos de mimetismo molecular en el proteoma del patógeno de maíz Ustilago maydis (Tesis de pregrado). Universidad de las Américas, Quito.
Resumen : El mimetismo molecular es una de las estrategias evolutivas que utilizan los patógenos para manipular el metabolismo y las funciones del huésped. Se han diseñado varias estrategias para detectar casos de mimetismo molecular in sílico; sin embargo, no se ha desarrollado un modelo para detectar este fenómeno en sistemas planta-patógeno. En tal virtud, este trabajo desarrolló por primera vez un método in sílico para detectar candidatos miméticos, usando el patosistema Ustilago maydis- Zea mays como modelo. En esta metodología se utilizó una comparación de secuencias entre el proteoma del patógeno, del huésped y de los hongos no fitopatógenos. Además, se determinó la localización subcelular de los candidatos imitador-imitado. Por otra parte, se utilizó información de RNA-seq para identificar la co-expresión de los candidatos. Entre los candidatos de mayor relevancia obtenidos por este método destacan: UDP-glucose: glycoprotein glycosyltransferase, Diaphanous-related Formin, Phospholipid: diacylglycerol acyltransferase 1. Estas tres proteínas están involucradas en la división celular, y el establecimiento en plantas de la respuesta ante patógenos. Por tal razón, estos son candidatos con potencial para manipular las células vegetales en beneficio del patógeno.
Descripción : Molecular mimicry is one of the evolutionary strategies that pathogens use to manipulate host metabolism and functions. Several strategies have been designed to detect cases of molecular mimicry in silica; However, a model has not been developed to detect this phenomenon in plant-pathogenic systems. As such, this work developed for the first time an in silico method to detect mimetic candidates, using the Ustilago maydis-Zea mays patosystem as a model. In this methodology, a sequence comparison between the proteome of the pathogen, the host and non-phytopathogenic fungi was used. In addition, the subcellular location of the mimicked-imitated candidates was determined. On the other hand, RNA-seq information was used to identify the co-expression of the candidates. Among the most important candidates obtained by this method are: UDP-glucose: glycoprotein glycosyltransferase, Diaphanous-related Formin, Phospholipid: diacylglycerol acyltransferase 1. These three proteins are involved in cell division, and plant establishment of the response to pathogens . For this reason, these are candidates with potential to manipulate plant cells for the benefit of the pathogen.
URI : http://dspace.udla.edu.ec/handle/33000/11447
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