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Tipo de material : bachelorThesis
Título : Evaluación de la diversidad genética entre poblaciones de Metrichia de la cordillera andina ecuatoriana
Autor : Loachamín Punina, Gisella Noemí
Tutor : Ballesteros Redondo, María Isabel
Palabras clave : GENÉTICA ANIMAL;DIVERSIDAD GENÉTICA;BIOLOGÍA MOLECULAR
Fecha de publicación : 2019
Editorial : Quito: Universidad de las Américas, 2019
Citación : Loachamín Punina, G. N. (2019). Evaluación de la diversidad genética entre poblaciones de Metrichia de la cordillera andina ecuatoriana (Tesis de pregrado). Universidad de las Américas, Quito.
Resumen : El funcionamiento ideal de los ecosistemas se encuentra directamente relacionado con la conservación de las especies, por lo tanto, el estudio de la diversidad de las mismas es una prioridad para los investigadores. En Ecuador estudios previos realizados sobre Trichoptera, específicamente en la especie Anomalocosmoecus illiesi, mostraron una variación interpoblacional relativamente alta entre los individuos, generando una pauta para el estudio de otras especies pertenecientes a este orden, los cuales son usados como bioindicadores para evaluar la calidad de los ecosistemas acuáticos. De esta manera, se propuso el género Metrichia, por su reducido tamaño es catalogado en la diversidad críptica, por consiguiente, el estudio fenotípico debe ser complementado. Para este trabajo se propuso el uso de la filogeografía, que en base a secuencias de ADN y la distribución geográfica puede interpretar la relación entre poblaciones o especies estrechamente relacionadas. Para inferir la diversidad de genes entre las poblaciones, se empleó el ADN mitocondrial de la proteína citocromo c oxidasa subunidad I (COI) y el ADN ribosómico (ADNr) 16S, en muestras tomadas de las cuencas de los volcanes Illinizas, Chimborazo y del Parque Ecológico Cajas. Los análisis se realizaron en 36 fragmentos del gen de ADNmt COI de 477 pb y en 45 secuencias de 400 pb para el gen 16S. Se analizó la variabilidad genética del género a través del modelo de Kimura de 2 parámetros en el programa MEGA7 con lo que se determinó que la población tuvo un 21,7% de divergencia genética. Sin embargo, dado que en Ecuador no existen estudios sobre las especies del género Metrichia, para el análisis filogenético se utilizó el programa Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD) que agrupa las muestras en unidades taxonómicas operativas basado en el porcentaje de divergencia, de este modo, se determinaron 5 unidades taxonómicas experimentales (MOTUs) con lo que se concluyó que existen poblaciones distribuidas a lo largo de la cordillera ecuatoriana, además de que se evidenció una facilidad de flujo de genes entre las mismas por medio del callejón interandino.
Descripción : The ideal functioning of ecosystems is directly related to the conservation of species, therefore, the study of their diversity is a priority for researchers. In Ecuador, previous studies on Trichoptera, specifically in the Anomalocosmoecus illiesi species, showed a relatively high interpopulation variation among individuals, generating a guideline for the study of other species belonging to this order, which are used as bioindicators to assess the quality of Aquatic ecosystems In this way, the genus Metrichia was proposed, because of its small size it is cataloged in cryptic diversity, therefore, the phenotypic study must be complemented. For this work the use of phylogeography was proposed, which based on DNA sequences and geographic distribution can interpret the relationship between populations or closely related species. To infer the diversity of genes among populations, mitochondrial DNA from the cytochrome c oxidase subunit I (IOC) protein and 16S ribosomal DNA (rDNA) was used in samples taken from the Illinizas, Chimborazo and Park volcano basins Ecological boxes. The analyzes were performed on 36 fragments of the 477 bp COI mtDNA gene and 45 sequences of 400 bp for the 16S gene. The genetic variability of the gender was analyzed through the Kimura model of 2 parameters in the MEGA7 program, which determined that the population had a 21.7% genetic divergence. However, since in Ecuador there are no studies on the species of the genus Metrichia, the Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD) program that groups the samples into operational taxonomic units based on the percentage of divergence was used for phylogenetic analysis, thus , 5 experimental taxonomic units (MOTUs) were determined, with which it was concluded that there are populations distributed along the Ecuadorian mountain range, in addition to an ease of gene flow between them through the inter-Andean alley.
URI : http://dspace.udla.edu.ec/handle/33000/11445
Aparece en las colecciones: Ingeniería en Biotecnología

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