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Tipo de material : bachelorThesis
Título : Análisis de secuencias de marcadores moleculares de introgresión en variedades de origen andino y mesoaméricas de fréjol (Phaseolus vulgaris)
Autor : López Córdova, Paola Denisse
Tutor : Morillo Velasteguí, Luis Eduardo
Palabras clave : LEGUMBRE;PRODUCTOS AGRÍCOLAS;GENÉTICA VEGETAL
Fecha de publicación : 2019
Editorial : Quito: Universidad de las Américas, 2019
Citación : López Córdova, P. D. (2019). Análisis de secuencias de marcadores moleculares de introgresión en variedades de origen andino y mesoamericas de fréjol (Phaseolus vulgaris). (Tesis de pregrado). Universidad de las Américas, Quito.
Resumen : El fréjol común (Phaseolus vulgaris L.) o también conocido como: poroto, judía y habichuela, es considerado una de las leguminosas de mayor importancia para el consumo humano. El fréjol es una fuente rica en proteína, hidratos de carbono, vitaminas y minerales; además, puede producirse en diversos sistemas de cultivos, y ambientes, lo que facilita que sea una especie cosmopolita. En el Ecuador la producción de fréjol alcanza un porcentaje del 0.2 por ciento de la producción mundial, lo que corresponde aproximadamente 5.127 ha del área cultivada. El origen del fréjol no se ha podido aclarar aún. En Mesoamérica y la región Andina se han cuestionado el origen y edad del fréjol. Estudios previamente realizados en el Ecuador reportaron la presencia de alelos mesoamericanos en variedades tradicionales andinas; sin embargo, estos resultados no son concluyentes debido a las técnicas utilizadas como: la electroforesis para el genotipaje de marcadores microsatélites y el tamaño de los fragmentos que dificultan la cantidad de polimorfismo. Este estudio tiene como objetivo analizar la variación genética de los marcadores candidatos de introgresión en variedades de fréjol de origen andino y mesoamericano, para lo cual se establecieron las condiciones óptimas de PCR para amplificar la gama alélica por marcador y definir alelos introgresados de interés. Se secuenciaron los alelos microsatélites (SSR) de secuencia extendida. Cuando los alelos fueron homocigotos se secuenciaron directamente, y cuando fueron heterocigotos, se clonaron. Con estos datos se realizó un análisis filogenético para los tres loci en estudio BM156, BM160, BM183, donde se mostró que el marcador BM 160 es el que mayor nivel de polimorfismo en secuencia colindante presentó y el apropiado para probar la hipótesis de introgresión. Este marcador diferenció claramente entre alelos mesoamericanos y andinos con un nivel de robustez estadístico superior al 75- 80 por ciento
Descripción : Common bean (Phaseolus vulgaris L.) or also known as bean, bean and snap bean, is considered one of the most important legumes for human consumption. Beans are some source rich in proteins, carbohydrates, vitamins and minerals. In addition, it can be produced in diverse systems of crops and environments, which facilitates it’s being a cosmopolitan specie. In Ecuador, bean production reaches a percentage of 0.2 percent of world production, which corresponds to approximately 5.127 ha of cultivated area. The origin of beans has not been clarified yet. In Mesoamerica and the Andean region, the origin and age of beans have been questioned. Previously conducted studies in Ecuador reported the presence of Mesoamerican alleles in traditional Andean varieties. However, these results are not conclusive due to the techniques used, such as: electrophoresis for the genotyping of micro satellite markers and the size of fragments that hinder the amount of polymorphism. The objective of this study was to analyze the genetic variation of the candidate markers of introgression in varieties of beans of Andean and Mesoamerican origin, for which optimal PCR conditions were established to amplify the allelic range by marker and to define introgressed alleles of interest. The extended sequence microsatellite alleles (SSR) were sequenced. When the alleles were homozygous, they were directly sequenced, and when they were heterozygous, they were cloned. With these data, a phylogenetic analysis was performed for three loci in study: BM 156, BM 160, BM 183, where it was shown that marker BM 160 is the one with the highest polymorphism level in adjoining sequence and the more appropriate to test the hypothesis of introgression This marker clearly differentiated between Mesoamerican and Andean alleles with a statistical robustness level greater than 75-80 percent Key words: Bean (Phaseolus vulgaris), Bean Origin and Domestication, Introgression, microsatellite markers and sequencing
URI : http://dspace.udla.edu.ec/handle/33000/10826
Aparece en las colecciones: Ingeniería en Biotecnología

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