Análisis de la diversidad genética y la filogeografía del género polypedilum en un gradiente altitudinal

Abstract

El análisis de la diversidad genética y la filogeografía de un género permite identificar especies y determinar la distribución geográfica de las mismas, estos estudios se aplican sobre todo a poblaciones de interés como bioindicadores de la calidad del agua; donde los insectos son las poblaciones más usadas en este tipo de investigaciones. Los estudios previos en los ríos de la provincia de El Oro mostraron al género Polypedilum como el más común en casi todos los ríos de esta provincia, por ello en este estudio se planteó analizar la diversidad genética y la filogeografía de este género un gradiente altitudinal. En primer lugar, se obtuvo el material genético de 131 larvas de dicho género, la extracción con mayor rendimiento fue mediante trituración con pistilo, extracción con CTAB y purificación con Fenol-cloroformo. En segundo lugar, se obtuvieron secuencias de 464 pares de bases de la región 5 de la subunidad 1 de la Citocromo Oxidasa mediante una PCR anidada y un proceso de secuenciación con los cebadores MT6 y Nancy; del 52,67 porcentaje de la población. En tercer lugar, se analizó la variabilidad genética del género a través del modelo de Kimura de 2 parámetros en el programa MEGA7 con lo que se determinó que la población tuvo un 13 porcentaje de divergencia genética. Además, a nivel de gradiente, fue el rango altitudinal 2 el grupo con mayor diversidad genética 12,62 porcentaje. Por otro lado, a nivel de los puntos de muestreo, el punto EOP020 correspondiente al río Ortega fue la localidad con mayor diversidad genética 13,22 porcentaje , mientras que el punto EOP049 correspondiente al río Casacay fue el punto con menor diversidad 4,06 porcentaje. A continuación, se determinaron 25 unidades taxonómicas experimentales (OTUs) para realizar el análisis filogenético, debido a la falta de información bioinformática de las especies del género Polypedilum del Ecuador mediante el programa Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD) que usa el porcentaje de divergencia en las muestras para agruparlas en unidades taxonómicas operativas y con ellas se realizó el análisis filogenético, con el cual se concluyó que existen poblaciones distribuidas a lo largo de toda la provincia y otras poblaciones son específicas de un punto de muestreo. En conclusión, el género Polypedilum muestra una gran diversidad genética con lo que se presume una gran variedad de especies y el análisis filogenético reflejó la posibilidad de que el gradiente altitudinal no es una barrera para el flujo genético de este género en la Provincia de El Oro, aunque existen OTUs que son específicos de rangos altitudinales altos o bajo y esto podría deberse a otras condiciones ecológicas como la cantidad de materia orgánica o contaminantes de los ríos en los cuales se recogieron las muestras.