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Tipo de material : bachelorThesis
Título : Análisis de la diversidad genética y la filogeografía del género polypedilum en un gradiente altitudinal
Autor : Bravo Castro, Ana Mishell
Tutor : Ballesteros Redondo, María Isabel
Palabras clave : GENÉTICA VEGETAL;INFORMACIÓN GEOGRÁFICA;EL ORO-ECUADOR
Fecha de publicación : 2019
Editorial : Quito: Universidad de las Américas, 2019.
Citación : Bravo Castro, A. M. (2019). Análisis de la diversidad genética y la filogeografía del género polypedilum en un gradiente altitudinal (Tesis de pregrado). Universidad de las Américas, Quito.
Resumen : El análisis de la diversidad genética y la filogeografía de un género permite identificar especies y determinar la distribución geográfica de las mismas, estos estudios se aplican sobre todo a poblaciones de interés como bioindicadores de la calidad del agua; donde los insectos son las poblaciones más usadas en este tipo de investigaciones. Los estudios previos en los ríos de la provincia de El Oro mostraron al género Polypedilum como el más común en casi todos los ríos de esta provincia, por ello en este estudio se planteó analizar la diversidad genética y la filogeografía de este género un gradiente altitudinal. En primer lugar, se obtuvo el material genético de 131 larvas de dicho género, la extracción con mayor rendimiento fue mediante trituración con pistilo, extracción con CTAB y purificación con Fenol-cloroformo. En segundo lugar, se obtuvieron secuencias de 464 pares de bases de la región 5 de la subunidad 1 de la Citocromo Oxidasa mediante una PCR anidada y un proceso de secuenciación con los cebadores MT6 y Nancy; del 52,67 porcentaje de la población. En tercer lugar, se analizó la variabilidad genética del género a través del modelo de Kimura de 2 parámetros en el programa MEGA7 con lo que se determinó que la población tuvo un 13 porcentaje de divergencia genética. Además, a nivel de gradiente, fue el rango altitudinal 2 el grupo con mayor diversidad genética 12,62 porcentaje. Por otro lado, a nivel de los puntos de muestreo, el punto EOP020 correspondiente al río Ortega fue la localidad con mayor diversidad genética 13,22 porcentaje , mientras que el punto EOP049 correspondiente al río Casacay fue el punto con menor diversidad 4,06 porcentaje. A continuación, se determinaron 25 unidades taxonómicas experimentales (OTUs) para realizar el análisis filogenético, debido a la falta de información bioinformática de las especies del género Polypedilum del Ecuador mediante el programa Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD) que usa el porcentaje de divergencia en las muestras para agruparlas en unidades taxonómicas operativas y con ellas se realizó el análisis filogenético, con el cual se concluyó que existen poblaciones distribuidas a lo largo de toda la provincia y otras poblaciones son específicas de un punto de muestreo. En conclusión, el género Polypedilum muestra una gran diversidad genética con lo que se presume una gran variedad de especies y el análisis filogenético reflejó la posibilidad de que el gradiente altitudinal no es una barrera para el flujo genético de este género en la Provincia de El Oro, aunque existen OTUs que son específicos de rangos altitudinales altos o bajo y esto podría deberse a otras condiciones ecológicas como la cantidad de materia orgánica o contaminantes de los ríos en los cuales se recogieron las muestras.
Descripción : The analysis of genetic diversity and the phylogeography of a genus allows us to identify species and determine their geographical distribution; these studies are applied mainly to populations of interest as bioindicators of water quality; where insects are the most used populations in this type of research. Previous studies in the rivers of the province of El Oro showed the genus Polypedilum as the most common in almost all rivers in this province, so in this study it was proposed to analyze the genetic diversity and phylogeography of this genus an altitudinal gradient. First, the genetic material of 131 larvae of this genus was obtained, extraction with greater yield was by trituration with pistil, extraction with CTAB and purification with phenol-chloroform. Second, sequences of 464 base pairs from the 5 'region of subunit 1 of Cytochrome Oxidase were obtained by nested PCR and a sequencing process with primers MT6 and Nancy; of 52.67 porcent of the population. Third, the genetic variability of the genus was analyzed through the Kimura model of 2 parameters in the MEGA7 program, which determined that the population had a 13 porcent genetic divergence. In addition, at the gradient level, the altitudinal range 2 was the group with the highest genetic diversity (12.62 porcent ). On the other hand, at the sampling point level, the EOP020 point corresponding to the Ortega River was the location with the greatest genetic diversity (13.22 porcent ), while the EOP049 point corresponding to the Casacay River was the point with the least diversity (4,06 porcent ). Then, 25 experimental taxonomic units (OTUs) were determined to carry out the phylogenetic analysis, due to the lack of bioinformatics information of the Polypedilum species of Ecuador through the Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD) program that uses the percentage of divergence in the samples to be grouped into operational taxonomic units and with them the phylogenetic analysis was carried out, with which it was concluded that there are populations distributed throughout the province and other populations are specific to a sampling point. In conclusion, the genus Polypedilum shows a great genetic diversity with what is presumed a great variety of species and the phylogenetic analysis reflected the possibility that the altitudinal gradient is not a barrier to the genetic flow of this genus in the Province of El Oro , although there are OTUs that are specific to high or low altitudinal ranges and this could be due to other ecological conditions such as the amount of organic matter or pollutants of the rivers in which the samples were collected
URI : http://dspace.udla.edu.ec/handle/33000/10656
Aparece en las colecciones: Ingeniería en Biotecnología

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